Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SeboxP70368 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SeboxP70368 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SeboxP70368 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SeboxP70368 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SeboxP70368 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SeboxP70368 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SeboxP70368 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SeboxP70368 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SeboxP70368 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SeboxP70368 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SeboxP70368 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SeboxP70368 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SeboxP70368 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SeboxP70368 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SeboxP70368 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SeboxP70368 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SeboxP70368 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SeboxP70368 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SeboxP70368 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SeboxP70368 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SeboxP70368 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SeboxP70368 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SeboxP70368 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SeboxP70368 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SeboxP70368 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SeboxP70368 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SeboxP70368 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SeboxP70368 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SeboxP70368 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SeboxP70368 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SeboxP70368 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SeboxP70368 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SeboxP70368 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SeboxP70368 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SeboxP70368 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SeboxP70368 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SeboxP70368 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SeboxP70368 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SeboxP70368 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SeboxP70368 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SeboxP70368 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SeboxP70368 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SeboxP70368 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SeboxP70368 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SeboxP70368 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SeboxP70368 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SeboxP70368 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SeboxP70368 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SeboxP70368 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SeboxP70368 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SeboxP70368 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SeboxP70368 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SeboxP70368 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SeboxP70368 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SeboxP70368 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SeboxP70368 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SeboxP70368 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SeboxP70368 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SeboxP70368 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SeboxP70368 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SeboxP70368 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SeboxP70368 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SeboxP70368 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SeboxP70368 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SeboxP70368 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SeboxP70368 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SeboxP70368 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SeboxP70368 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SeboxP70368 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SeboxP70368 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SeboxP70368 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SeboxP70368 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SeboxP70368 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SeboxP70368 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SeboxP70368 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SeboxP70368 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SeboxP70368 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SeboxP70368 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SeboxP70368 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SeboxP70368 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SeboxP70368 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SeboxP70368 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SeboxP70368 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SeboxP70368 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SeboxP70368 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SeboxP70368 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SeboxP70368 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SeboxP70368 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SeboxP70368 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SeboxP70368 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SeboxP70368 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SeboxP70368 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SeboxP70368 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SeboxP70368 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SeboxP70368 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SeboxP70368 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SeboxP70368 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SeboxP70368 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SeboxP70368 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms