Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tra2bP62996 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tra2bP62996 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tra2bP62996 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tra2bP62996 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tra2bP62996 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tra2bP62996 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tra2bP62996 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tra2bP62996 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tra2bP62996 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tra2bP62996 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tra2bP62996 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tra2bP62996 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tra2bP62996 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tra2bP62996 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tra2bP62996 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tra2bP62996 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tra2bP62996 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tra2bP62996 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tra2bP62996 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tra2bP62996 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tra2bP62996 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tra2bP62996 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tra2bP62996 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tra2bP62996 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tra2bP62996 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tra2bP62996 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tra2bP62996 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tra2bP62996 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tra2bP62996 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tra2bP62996 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tra2bP62996 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tra2bP62996 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tra2bP62996 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tra2bP62996 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tra2bP62996 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tra2bP62996 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tra2bP62996 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tra2bP62996 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tra2bP62996 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tra2bP62996 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tra2bP62996 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tra2bP62996 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tra2bP62996 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tra2bP62996 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tra2bP62996 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tra2bP62996 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tra2bP62996 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tra2bP62996 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tra2bP62996 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tra2bP62996 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tra2bP62996 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tra2bP62996 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tra2bP62996 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tra2bP62996 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tra2bP62996 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tra2bP62996 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tra2bP62996 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tra2bP62996 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tra2bP62996 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tra2bP62996 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tra2bP62996 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tra2bP62996 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tra2bP62996 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tra2bP62996 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tra2bP62996 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tra2bP62996 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tra2bP62996 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tra2bP62996 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tra2bP62996 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tra2bP62996 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tra2bP62996 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tra2bP62996 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tra2bP62996 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tra2bP62996 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tra2bP62996 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tra2bP62996 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tra2bP62996 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tra2bP62996 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tra2bP62996 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tra2bP62996 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tra2bP62996 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms