Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defb1P56386 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defb1P56386 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defb1P56386 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defb1P56386 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defb1P56386 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defb1P56386 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Defb1P56386 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defb1P56386 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defb1P56386 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defb1P56386 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms