Protein–RNA interactions for Protein: P50705

Defa7, Alpha-defensin 7, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa7P50705 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa7P50705 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa7P50705 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa7P50705 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa7P50705 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa7P50705 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa7P50705 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa7P50705 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa7P50705 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa7P50705 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa7P50705 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa7P50705 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa7P50705 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa7P50705 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa7P50705 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa7P50705 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa7P50705 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa7P50705 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa7P50705 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa7P50705 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa7P50705 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa7P50705 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa7P50705 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa7P50705 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa7P50705 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa7P50705 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa7P50705 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa7P50705 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa7P50705 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa7P50705 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa7P50705 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa7P50705 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa7P50705 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa7P50705 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa7P50705 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa7P50705 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa7P50705 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa7P50705 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa7P50705 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa7P50705 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa7P50705 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa7P50705 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa7P50705 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa7P50705 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa7P50705 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa7P50705 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa7P50705 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa7P50705 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa7P50705 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa7P50705 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa7P50705 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa7P50705 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa7P50705 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa7P50705 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa7P50705 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa7P50705 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms