Protein–RNA interactions for Protein: P50428

Arsa, Arylsulfatase A, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArsaP50428 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ArsaP50428 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ArsaP50428 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ArsaP50428 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ArsaP50428 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ArsaP50428 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ArsaP50428 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ArsaP50428 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ArsaP50428 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ArsaP50428 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ArsaP50428 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ArsaP50428 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ArsaP50428 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ArsaP50428 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ArsaP50428 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ArsaP50428 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ArsaP50428 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ArsaP50428 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ArsaP50428 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ArsaP50428 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ArsaP50428 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ArsaP50428 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ArsaP50428 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ArsaP50428 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ArsaP50428 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ArsaP50428 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ArsaP50428 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ArsaP50428 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ArsaP50428 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ArsaP50428 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ArsaP50428 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ArsaP50428 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ArsaP50428 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ArsaP50428 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ArsaP50428 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ArsaP50428 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ArsaP50428 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ArsaP50428 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ArsaP50428 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ArsaP50428 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArsaP50428 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArsaP50428 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ArsaP50428 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ArsaP50428 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ArsaP50428 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ArsaP50428 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ArsaP50428 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ArsaP50428 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ArsaP50428 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ArsaP50428 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ArsaP50428 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ArsaP50428 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ArsaP50428 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArsaP50428 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArsaP50428 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArsaP50428 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ArsaP50428 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArsaP50428 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArsaP50428 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ArsaP50428 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArsaP50428 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArsaP50428 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArsaP50428 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArsaP50428 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArsaP50428 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArsaP50428 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArsaP50428 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ArsaP50428 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ArsaP50428 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ArsaP50428 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ArsaP50428 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArsaP50428 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArsaP50428 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArsaP50428 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ArsaP50428 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ArsaP50428 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ArsaP50428 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ArsaP50428 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ArsaP50428 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ArsaP50428 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ArsaP50428 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArsaP50428 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ArsaP50428 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ArsaP50428 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ArsaP50428 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ArsaP50428 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ArsaP50428 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ArsaP50428 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ArsaP50428 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ArsaP50428 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ArsaP50428 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArsaP50428 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArsaP50428 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArsaP50428 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArsaP50428 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArsaP50428 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArsaP50428 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArsaP50428 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArsaP50428 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArsaP50428 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms