Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VegfbP49766 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VegfbP49766 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VegfbP49766 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VegfbP49766 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VegfbP49766 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VegfbP49766 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VegfbP49766 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VegfbP49766 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VegfbP49766 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VegfbP49766 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VegfbP49766 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VegfbP49766 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VegfbP49766 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VegfbP49766 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VegfbP49766 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VegfbP49766 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VegfbP49766 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VegfbP49766 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VegfbP49766 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VegfbP49766 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VegfbP49766 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VegfbP49766 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VegfbP49766 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VegfbP49766 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
VegfbP49766 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VegfbP49766 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VegfbP49766 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VegfbP49766 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VegfbP49766 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VegfbP49766 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VegfbP49766 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VegfbP49766 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VegfbP49766 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VegfbP49766 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VegfbP49766 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VegfbP49766 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
VegfbP49766 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VegfbP49766 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VegfbP49766 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VegfbP49766 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VegfbP49766 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VegfbP49766 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VegfbP49766 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VegfbP49766 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VegfbP49766 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VegfbP49766 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VegfbP49766 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VegfbP49766 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VegfbP49766 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VegfbP49766 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VegfbP49766 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VegfbP49766 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VegfbP49766 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VegfbP49766 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VegfbP49766 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VegfbP49766 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VegfbP49766 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VegfbP49766 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VegfbP49766 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VegfbP49766 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VegfbP49766 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VegfbP49766 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VegfbP49766 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VegfbP49766 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VegfbP49766 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VegfbP49766 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VegfbP49766 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VegfbP49766 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VegfbP49766 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
VegfbP49766 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VegfbP49766 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VegfbP49766 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VegfbP49766 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VegfbP49766 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VegfbP49766 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VegfbP49766 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VegfbP49766 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VegfbP49766 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VegfbP49766 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VegfbP49766 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VegfbP49766 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VegfbP49766 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VegfbP49766 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VegfbP49766 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VegfbP49766 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VegfbP49766 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VegfbP49766 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VegfbP49766 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
VegfbP49766 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VegfbP49766 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VegfbP49766 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
VegfbP49766 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VegfbP49766 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
VegfbP49766 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
VegfbP49766 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VegfbP49766 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
VegfbP49766 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
VegfbP49766 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VegfbP49766 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms