Protein–RNA interactions for Protein: P48776

Tdo2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdo2P48776 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Tdo2P48776 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Tdo2P48776 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Tdo2P48776 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Tdo2P48776 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Tdo2P48776 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Tdo2P48776 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Tdo2P48776 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Tdo2P48776 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Tdo2P48776 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Tdo2P48776 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Tdo2P48776 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Tdo2P48776 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Tdo2P48776 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
Tdo2P48776 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Tdo2P48776 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Tdo2P48776 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Tdo2P48776 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Tdo2P48776 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Tdo2P48776 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Tdo2P48776 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Tdo2P48776 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Tdo2P48776 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Tdo2P48776 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Tdo2P48776 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Tdo2P48776 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Tdo2P48776 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Tdo2P48776 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Tdo2P48776 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Tdo2P48776 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Tdo2P48776 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Tdo2P48776 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Tdo2P48776 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Tdo2P48776 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Tdo2P48776 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Tdo2P48776 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Tdo2P48776 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Tdo2P48776 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Tdo2P48776 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Tdo2P48776 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Tdo2P48776 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Tdo2P48776 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Tdo2P48776 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Tdo2P48776 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Tdo2P48776 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Tdo2P48776 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28,19■■■□□ 2,1
Tdo2P48776 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Tdo2P48776 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Tdo2P48776 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Tdo2P48776 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Tdo2P48776 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Tdo2P48776 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Tdo2P48776 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Tdo2P48776 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Tdo2P48776 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Tdo2P48776 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Tdo2P48776 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Tdo2P48776 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Tdo2P48776 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Tdo2P48776 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Tdo2P48776 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Tdo2P48776 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Tdo2P48776 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Tdo2P48776 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Tdo2P48776 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Tdo2P48776 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Tdo2P48776 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Tdo2P48776 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Tdo2P48776 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Tdo2P48776 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Tdo2P48776 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Tdo2P48776 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Tdo2P48776 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Tdo2P48776 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Tdo2P48776 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Tdo2P48776 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Tdo2P48776 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Tdo2P48776 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Tdo2P48776 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Tdo2P48776 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Tdo2P48776 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Tdo2P48776 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Tdo2P48776 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Tdo2P48776 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Tdo2P48776 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Tdo2P48776 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Tdo2P48776 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Tdo2P48776 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Tdo2P48776 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Tdo2P48776 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Tdo2P48776 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Tdo2P48776 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Tdo2P48776 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Tdo2P48776 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Tdo2P48776 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Tdo2P48776 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Tdo2P48776 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27,91■■■□□ 2,06
Tdo2P48776 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27,91■■■□□ 2,06
Tdo2P48776 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Tdo2P48776 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,1 ms