Protein–RNA interactions for Protein: P35343

Cxcr2, C-X-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr2P35343 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cxcr2P35343 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cxcr2P35343 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cxcr2P35343 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cxcr2P35343 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cxcr2P35343 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cxcr2P35343 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cxcr2P35343 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cxcr2P35343 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cxcr2P35343 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cxcr2P35343 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cxcr2P35343 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cxcr2P35343 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cxcr2P35343 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cxcr2P35343 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cxcr2P35343 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cxcr2P35343 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cxcr2P35343 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cxcr2P35343 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cxcr2P35343 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cxcr2P35343 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cxcr2P35343 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cxcr2P35343 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cxcr2P35343 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cxcr2P35343 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cxcr2P35343 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cxcr2P35343 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cxcr2P35343 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cxcr2P35343 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cxcr2P35343 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cxcr2P35343 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cxcr2P35343 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cxcr2P35343 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cxcr2P35343 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cxcr2P35343 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cxcr2P35343 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cxcr2P35343 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cxcr2P35343 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cxcr2P35343 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cxcr2P35343 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cxcr2P35343 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cxcr2P35343 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cxcr2P35343 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cxcr2P35343 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cxcr2P35343 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cxcr2P35343 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cxcr2P35343 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cxcr2P35343 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cxcr2P35343 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcr2P35343 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcr2P35343 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcr2P35343 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcr2P35343 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcr2P35343 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcr2P35343 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcr2P35343 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcr2P35343 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcr2P35343 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cxcr2P35343 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cxcr2P35343 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cxcr2P35343 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cxcr2P35343 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cxcr2P35343 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cxcr2P35343 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cxcr2P35343 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cxcr2P35343 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cxcr2P35343 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cxcr2P35343 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cxcr2P35343 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcr2P35343 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcr2P35343 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcr2P35343 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcr2P35343 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcr2P35343 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcr2P35343 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcr2P35343 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcr2P35343 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cxcr2P35343 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcr2P35343 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cxcr2P35343 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cxcr2P35343 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cxcr2P35343 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cxcr2P35343 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cxcr2P35343 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cxcr2P35343 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cxcr2P35343 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cxcr2P35343 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cxcr2P35343 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cxcr2P35343 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cxcr2P35343 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cxcr2P35343 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cxcr2P35343 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cxcr2P35343 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cxcr2P35343 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cxcr2P35343 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cxcr2P35343 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cxcr2P35343 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cxcr2P35343 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cxcr2P35343 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cxcr2P35343 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms