Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab3dP35276 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab3dP35276 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab3dP35276 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab3dP35276 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab3dP35276 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab3dP35276 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab3dP35276 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab3dP35276 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab3dP35276 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab3dP35276 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab3dP35276 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab3dP35276 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab3dP35276 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab3dP35276 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab3dP35276 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab3dP35276 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab3dP35276 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab3dP35276 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab3dP35276 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab3dP35276 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab3dP35276 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab3dP35276 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab3dP35276 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab3dP35276 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab3dP35276 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab3dP35276 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab3dP35276 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab3dP35276 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab3dP35276 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab3dP35276 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab3dP35276 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab3dP35276 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab3dP35276 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab3dP35276 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab3dP35276 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab3dP35276 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab3dP35276 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab3dP35276 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab3dP35276 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab3dP35276 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab3dP35276 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab3dP35276 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab3dP35276 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab3dP35276 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab3dP35276 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab3dP35276 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab3dP35276 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab3dP35276 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab3dP35276 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab3dP35276 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab3dP35276 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab3dP35276 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab3dP35276 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab3dP35276 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab3dP35276 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab3dP35276 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab3dP35276 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab3dP35276 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab3dP35276 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab3dP35276 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab3dP35276 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab3dP35276 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab3dP35276 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab3dP35276 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab3dP35276 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab3dP35276 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab3dP35276 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab3dP35276 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab3dP35276 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab3dP35276 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab3dP35276 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rab3dP35276 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab3dP35276 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab3dP35276 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab3dP35276 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab3dP35276 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab3dP35276 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab3dP35276 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab3dP35276 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab3dP35276 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab3dP35276 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab3dP35276 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab3dP35276 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab3dP35276 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab3dP35276 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab3dP35276 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab3dP35276 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab3dP35276 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab3dP35276 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab3dP35276 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab3dP35276 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab3dP35276 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab3dP35276 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab3dP35276 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab3dP35276 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab3dP35276 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab3dP35276 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab3dP35276 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab3dP35276 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms