Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stfa1P35175 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stfa1P35175 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Stfa1P35175 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stfa1P35175 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stfa1P35175 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stfa1P35175 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stfa1P35175 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stfa1P35175 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stfa1P35175 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Stfa1P35175 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stfa1P35175 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stfa1P35175 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stfa1P35175 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stfa1P35175 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stfa1P35175 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stfa1P35175 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Stfa1P35175 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stfa1P35175 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stfa1P35175 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stfa1P35175 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stfa1P35175 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stfa1P35175 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stfa1P35175 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stfa1P35175 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stfa1P35175 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stfa1P35175 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stfa1P35175 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stfa1P35175 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stfa1P35175 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stfa1P35175 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stfa1P35175 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stfa1P35175 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stfa1P35175 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stfa1P35175 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stfa1P35175 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stfa1P35175 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stfa1P35175 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stfa1P35175 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stfa1P35175 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Stfa1P35175 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stfa1P35175 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stfa1P35175 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stfa1P35175 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stfa1P35175 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stfa1P35175 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stfa1P35175 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stfa1P35175 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stfa1P35175 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stfa1P35175 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stfa1P35175 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stfa1P35175 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stfa1P35175 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stfa1P35175 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stfa1P35175 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stfa1P35175 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stfa1P35175 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stfa1P35175 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stfa1P35175 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stfa1P35175 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stfa1P35175 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stfa1P35175 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stfa1P35175 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Stfa1P35175 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stfa1P35175 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stfa1P35175 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stfa1P35175 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stfa1P35175 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stfa1P35175 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stfa1P35175 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stfa1P35175 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stfa1P35175 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stfa1P35175 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stfa1P35175 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Stfa1P35175 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stfa1P35175 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stfa1P35175 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stfa1P35175 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stfa1P35175 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stfa1P35175 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stfa1P35175 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stfa1P35175 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stfa1P35175 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stfa1P35175 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stfa1P35175 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stfa1P35175 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stfa1P35175 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stfa1P35175 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stfa1P35175 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stfa1P35175 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stfa1P35175 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stfa1P35175 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stfa1P35175 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stfa1P35175 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stfa1P35175 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stfa1P35175 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stfa1P35175 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Stfa1P35175 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Stfa1P35175 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stfa1P35175 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms