Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd40lgP27548 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd40lgP27548 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd40lgP27548 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd40lgP27548 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd40lgP27548 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd40lgP27548 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd40lgP27548 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd40lgP27548 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd40lgP27548 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd40lgP27548 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd40lgP27548 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd40lgP27548 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd40lgP27548 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd40lgP27548 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd40lgP27548 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd40lgP27548 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd40lgP27548 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd40lgP27548 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd40lgP27548 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd40lgP27548 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd40lgP27548 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd40lgP27548 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd40lgP27548 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd40lgP27548 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd40lgP27548 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd40lgP27548 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd40lgP27548 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd40lgP27548 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd40lgP27548 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd40lgP27548 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd40lgP27548 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd40lgP27548 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd40lgP27548 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd40lgP27548 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd40lgP27548 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd40lgP27548 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd40lgP27548 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd40lgP27548 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd40lgP27548 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd40lgP27548 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd40lgP27548 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd40lgP27548 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd40lgP27548 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd40lgP27548 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd40lgP27548 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cd40lgP27548 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd40lgP27548 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd40lgP27548 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd40lgP27548 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd40lgP27548 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd40lgP27548 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd40lgP27548 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd40lgP27548 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd40lgP27548 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd40lgP27548 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd40lgP27548 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd40lgP27548 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd40lgP27548 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd40lgP27548 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd40lgP27548 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd40lgP27548 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd40lgP27548 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd40lgP27548 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd40lgP27548 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd40lgP27548 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd40lgP27548 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd40lgP27548 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd40lgP27548 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd40lgP27548 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd40lgP27548 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd40lgP27548 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd40lgP27548 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd40lgP27548 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd40lgP27548 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd40lgP27548 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd40lgP27548 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd40lgP27548 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd40lgP27548 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd40lgP27548 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd40lgP27548 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd40lgP27548 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd40lgP27548 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd40lgP27548 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd40lgP27548 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd40lgP27548 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd40lgP27548 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd40lgP27548 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd40lgP27548 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd40lgP27548 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd40lgP27548 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd40lgP27548 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd40lgP27548 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd40lgP27548 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd40lgP27548 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd40lgP27548 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd40lgP27548 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd40lgP27548 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd40lgP27548 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd40lgP27548 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms