Protein–RNA interactions for Protein: P20782

Chrne, Acetylcholine receptor subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrneP20782 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChrneP20782 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChrneP20782 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChrneP20782 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ChrneP20782 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChrneP20782 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChrneP20782 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ChrneP20782 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChrneP20782 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChrneP20782 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChrneP20782 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChrneP20782 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChrneP20782 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChrneP20782 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChrneP20782 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChrneP20782 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChrneP20782 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ChrneP20782 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChrneP20782 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChrneP20782 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChrneP20782 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChrneP20782 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ChrneP20782 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChrneP20782 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ChrneP20782 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChrneP20782 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChrneP20782 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChrneP20782 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChrneP20782 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChrneP20782 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChrneP20782 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChrneP20782 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChrneP20782 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChrneP20782 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChrneP20782 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChrneP20782 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChrneP20782 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChrneP20782 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChrneP20782 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChrneP20782 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChrneP20782 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChrneP20782 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChrneP20782 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChrneP20782 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ChrneP20782 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChrneP20782 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChrneP20782 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChrneP20782 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChrneP20782 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChrneP20782 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChrneP20782 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChrneP20782 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ChrneP20782 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChrneP20782 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChrneP20782 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChrneP20782 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChrneP20782 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChrneP20782 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChrneP20782 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChrneP20782 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChrneP20782 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChrneP20782 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChrneP20782 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ChrneP20782 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChrneP20782 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ChrneP20782 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChrneP20782 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChrneP20782 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ChrneP20782 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChrneP20782 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChrneP20782 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChrneP20782 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChrneP20782 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChrneP20782 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChrneP20782 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChrneP20782 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChrneP20782 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChrneP20782 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChrneP20782 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChrneP20782 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChrneP20782 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChrneP20782 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ChrneP20782 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ChrneP20782 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ChrneP20782 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChrneP20782 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChrneP20782 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChrneP20782 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChrneP20782 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChrneP20782 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChrneP20782 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChrneP20782 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChrneP20782 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChrneP20782 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChrneP20782 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChrneP20782 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ChrneP20782 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChrneP20782 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChrneP20782 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChrneP20782 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms