Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01823 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01823 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01823 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
P01823 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01823 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01823 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01823 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01823 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01823 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01823 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01823 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01823 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01823 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01823 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01823 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01823 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01823 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01823 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01823 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01823 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01823 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01823 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
P01823 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01823 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01823 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01823 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01823 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01823 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01823 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01823 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01823 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01823 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01823 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01823 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01823 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01823 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01823 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01823 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01823 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01823 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01823 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01823 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P01823 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01823 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01823 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01823 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01823 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01823 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01823 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01823 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01823 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01823 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01823 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01823 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01823 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01823 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01823 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01823 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01823 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01823 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01823 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01823 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01823 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01823 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01823 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01823 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01823 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01823 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01823 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01823 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01823 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01823 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01823 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01823 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01823 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01823 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01823 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01823 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01823 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01823 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01823 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01823 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01823 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01823 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01823 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01823 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01823 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01823 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01823 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01823 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01823 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01823 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01823 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01823 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01823 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01823 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01823 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01823 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01823 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms