Protein–RNA interactions for Protein: P01629

Ig kappa chain V-II region 2S1.3, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01629 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01629 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01629 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01629 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01629 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01629 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01629 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
P01629 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01629 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01629 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01629 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01629 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01629 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01629 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01629 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01629 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01629 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01629 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01629 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
P01629 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
P01629 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
P01629 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01629 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01629 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01629 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
P01629 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01629 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01629 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01629 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01629 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01629 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01629 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01629 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01629 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
P01629 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01629 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
P01629 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01629 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01629 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01629 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01629 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01629 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
P01629 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01629 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01629 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
P01629 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01629 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01629 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01629 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01629 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01629 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01629 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01629 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01629 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01629 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01629 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P01629 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P01629 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01629 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01629 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01629 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
P01629 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01629 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01629 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
P01629 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01629 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01629 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01629 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
P01629 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01629 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01629 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01629 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01629 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01629 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01629 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01629 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01629 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01629 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
P01629 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01629 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01629 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01629 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01629 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01629 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01629 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01629 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01629 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01629 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01629 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01629 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
P01629 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01629 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01629 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01629 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01629 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01629 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01629 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
P01629 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01629 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
P01629 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms