Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Tom1O88746 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Tom1O88746 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Tom1O88746 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Tom1O88746 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Tom1O88746 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Tom1O88746 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Tom1O88746 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Tom1O88746 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Tom1O88746 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Tom1O88746 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Tom1O88746 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Tom1O88746 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Tom1O88746 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Tom1O88746 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Tom1O88746 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Tom1O88746 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Tom1O88746 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Tom1O88746 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Tom1O88746 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Tom1O88746 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Tom1O88746 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Tom1O88746 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Tom1O88746 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Tom1O88746 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Tom1O88746 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Tom1O88746 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Tom1O88746 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Tom1O88746 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Tom1O88746 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Tom1O88746 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Tom1O88746 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Tom1O88746 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Tom1O88746 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Tom1O88746 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Tom1O88746 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Tom1O88746 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Tom1O88746 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Tom1O88746 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Tom1O88746 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Tom1O88746 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Tom1O88746 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Tom1O88746 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Tom1O88746 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Tom1O88746 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Tom1O88746 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Tom1O88746 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Tom1O88746 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Tom1O88746 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Tom1O88746 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Tom1O88746 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Tom1O88746 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Tom1O88746 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Tom1O88746 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Tom1O88746 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Tom1O88746 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Tom1O88746 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Tom1O88746 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Tom1O88746 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Tom1O88746 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Tom1O88746 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Tom1O88746 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Tom1O88746 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Tom1O88746 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Tom1O88746 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Tom1O88746 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Tom1O88746 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Tom1O88746 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Tom1O88746 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Tom1O88746 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Tom1O88746 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Tom1O88746 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Tom1O88746 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Tom1O88746 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Tom1O88746 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Tom1O88746 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Tom1O88746 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Tom1O88746 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Tom1O88746 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Tom1O88746 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Tom1O88746 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Tom1O88746 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Tom1O88746 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Tom1O88746 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Tom1O88746 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Tom1O88746 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Tom1O88746 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Tom1O88746 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Tom1O88746 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Tom1O88746 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Tom1O88746 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Tom1O88746 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Tom1O88746 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Tom1O88746 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Tom1O88746 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Tom1O88746 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Tom1O88746 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Tom1O88746 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Tom1O88746 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Tom1O88746 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms