Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Lnx1O70263 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Lnx1O70263 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lnx1O70263 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lnx1O70263 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Lnx1O70263 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lnx1O70263 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lnx1O70263 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lnx1O70263 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lnx1O70263 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lnx1O70263 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lnx1O70263 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lnx1O70263 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lnx1O70263 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lnx1O70263 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lnx1O70263 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lnx1O70263 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lnx1O70263 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lnx1O70263 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lnx1O70263 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Lnx1O70263 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lnx1O70263 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lnx1O70263 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lnx1O70263 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lnx1O70263 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lnx1O70263 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lnx1O70263 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lnx1O70263 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lnx1O70263 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lnx1O70263 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lnx1O70263 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lnx1O70263 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lnx1O70263 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lnx1O70263 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lnx1O70263 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lnx1O70263 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lnx1O70263 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lnx1O70263 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Lnx1O70263 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lnx1O70263 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lnx1O70263 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lnx1O70263 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lnx1O70263 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lnx1O70263 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lnx1O70263 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lnx1O70263 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lnx1O70263 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lnx1O70263 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lnx1O70263 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Lnx1O70263 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lnx1O70263 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lnx1O70263 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lnx1O70263 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lnx1O70263 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lnx1O70263 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lnx1O70263 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lnx1O70263 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lnx1O70263 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lnx1O70263 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lnx1O70263 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lnx1O70263 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lnx1O70263 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lnx1O70263 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lnx1O70263 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lnx1O70263 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lnx1O70263 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lnx1O70263 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lnx1O70263 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lnx1O70263 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lnx1O70263 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lnx1O70263 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lnx1O70263 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lnx1O70263 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lnx1O70263 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lnx1O70263 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lnx1O70263 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lnx1O70263 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Lnx1O70263 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lnx1O70263 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lnx1O70263 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lnx1O70263 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lnx1O70263 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lnx1O70263 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lnx1O70263 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lnx1O70263 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lnx1O70263 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lnx1O70263 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lnx1O70263 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lnx1O70263 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lnx1O70263 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lnx1O70263 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Lnx1O70263 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lnx1O70263 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lnx1O70263 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lnx1O70263 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lnx1O70263 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lnx1O70263 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lnx1O70263 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lnx1O70263 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lnx1O70263 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
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