Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Lnx1O70263 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Lnx1O70263 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Lnx1O70263 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Lnx1O70263 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
Lnx1O70263 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Lnx1O70263 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Lnx1O70263 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Lnx1O70263 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Lnx1O70263 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Lnx1O70263 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Lnx1O70263 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Lnx1O70263 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Lnx1O70263 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Lnx1O70263 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Lnx1O70263 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Lnx1O70263 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Lnx1O70263 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Lnx1O70263 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Lnx1O70263 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28,89■■■□□ 2,21
Lnx1O70263 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Lnx1O70263 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Lnx1O70263 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Lnx1O70263 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Lnx1O70263 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Lnx1O70263 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Lnx1O70263 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Lnx1O70263 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Lnx1O70263 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Lnx1O70263 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Lnx1O70263 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Lnx1O70263 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Lnx1O70263 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Lnx1O70263 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Lnx1O70263 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Lnx1O70263 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Lnx1O70263 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Lnx1O70263 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28,81■■■□□ 2,2
Lnx1O70263 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Lnx1O70263 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Lnx1O70263 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Lnx1O70263 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Lnx1O70263 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Lnx1O70263 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Lnx1O70263 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Lnx1O70263 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Lnx1O70263 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Lnx1O70263 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Lnx1O70263 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28,74■■■□□ 2,19
Lnx1O70263 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Lnx1O70263 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Lnx1O70263 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Lnx1O70263 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Lnx1O70263 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Lnx1O70263 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Lnx1O70263 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Lnx1O70263 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Lnx1O70263 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Lnx1O70263 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Lnx1O70263 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Lnx1O70263 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Lnx1O70263 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Lnx1O70263 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Lnx1O70263 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Lnx1O70263 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Lnx1O70263 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Lnx1O70263 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Lnx1O70263 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Lnx1O70263 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Lnx1O70263 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Lnx1O70263 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Lnx1O70263 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Lnx1O70263 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Lnx1O70263 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Lnx1O70263 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Lnx1O70263 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Lnx1O70263 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28,56■■■□□ 2,16
Lnx1O70263 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Lnx1O70263 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Lnx1O70263 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Lnx1O70263 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Lnx1O70263 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Lnx1O70263 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Lnx1O70263 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Lnx1O70263 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Lnx1O70263 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Lnx1O70263 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Lnx1O70263 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Lnx1O70263 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Lnx1O70263 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Lnx1O70263 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Lnx1O70263 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Lnx1O70263 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Lnx1O70263 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Lnx1O70263 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Lnx1O70263 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Lnx1O70263 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Lnx1O70263 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Lnx1O70263 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Lnx1O70263 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms