Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 91 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smim22J3QP37 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smim22J3QP37 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smim22J3QP37 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smim22J3QP37 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smim22J3QP37 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smim22J3QP37 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smim22J3QP37 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Smim22J3QP37 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smim22J3QP37 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smim22J3QP37 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smim22J3QP37 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Smim22J3QP37 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smim22J3QP37 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smim22J3QP37 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smim22J3QP37 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Smim22J3QP37 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Smim22J3QP37 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smim22J3QP37 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smim22J3QP37 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Smim22J3QP37 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Smim22J3QP37 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smim22J3QP37 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smim22J3QP37 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smim22J3QP37 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smim22J3QP37 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smim22J3QP37 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smim22J3QP37 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Smim22J3QP37 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smim22J3QP37 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smim22J3QP37 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smim22J3QP37 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smim22J3QP37 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smim22J3QP37 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smim22J3QP37 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smim22J3QP37 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smim22J3QP37 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smim22J3QP37 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smim22J3QP37 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smim22J3QP37 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smim22J3QP37 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smim22J3QP37 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smim22J3QP37 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smim22J3QP37 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smim22J3QP37 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smim22J3QP37 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smim22J3QP37 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smim22J3QP37 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smim22J3QP37 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smim22J3QP37 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smim22J3QP37 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smim22J3QP37 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smim22J3QP37 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smim22J3QP37 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smim22J3QP37 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smim22J3QP37 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smim22J3QP37 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smim22J3QP37 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Smim22J3QP37 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smim22J3QP37 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smim22J3QP37 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smim22J3QP37 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smim22J3QP37 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smim22J3QP37 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smim22J3QP37 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smim22J3QP37 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Smim22J3QP37 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Smim22J3QP37 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smim22J3QP37 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smim22J3QP37 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Smim22J3QP37 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smim22J3QP37 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smim22J3QP37 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Smim22J3QP37 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smim22J3QP37 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smim22J3QP37 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smim22J3QP37 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smim22J3QP37 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smim22J3QP37 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smim22J3QP37 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smim22J3QP37 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smim22J3QP37 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smim22J3QP37 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smim22J3QP37 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smim22J3QP37 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smim22J3QP37 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smim22J3QP37 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smim22J3QP37 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smim22J3QP37 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smim22J3QP37 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smim22J3QP37 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smim22J3QP37 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smim22J3QP37 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smim22J3QP37 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smim22J3QP37 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smim22J3QP37 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smim22J3QP37 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smim22J3QP37 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smim22J3QP37 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Smim22J3QP37 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms