Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp870J3QMA4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp870J3QMA4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp870J3QMA4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp870J3QMA4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp870J3QMA4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp870J3QMA4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp870J3QMA4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp870J3QMA4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp870J3QMA4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp870J3QMA4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp870J3QMA4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp870J3QMA4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp870J3QMA4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp870J3QMA4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp870J3QMA4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp870J3QMA4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp870J3QMA4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp870J3QMA4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp870J3QMA4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp870J3QMA4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp870J3QMA4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp870J3QMA4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp870J3QMA4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp870J3QMA4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Zfp870J3QMA4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp870J3QMA4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp870J3QMA4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp870J3QMA4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp870J3QMA4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp870J3QMA4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp870J3QMA4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp870J3QMA4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp870J3QMA4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp870J3QMA4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp870J3QMA4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp870J3QMA4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp870J3QMA4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp870J3QMA4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp870J3QMA4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp870J3QMA4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp870J3QMA4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp870J3QMA4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp870J3QMA4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zfp870J3QMA4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp870J3QMA4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp870J3QMA4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp870J3QMA4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp870J3QMA4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp870J3QMA4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp870J3QMA4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp870J3QMA4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp870J3QMA4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp870J3QMA4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp870J3QMA4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp870J3QMA4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp870J3QMA4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp870J3QMA4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp870J3QMA4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp870J3QMA4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp870J3QMA4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp870J3QMA4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp870J3QMA4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp870J3QMA4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp870J3QMA4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp870J3QMA4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp870J3QMA4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp870J3QMA4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp870J3QMA4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp870J3QMA4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp870J3QMA4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp870J3QMA4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp870J3QMA4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp870J3QMA4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp870J3QMA4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp870J3QMA4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp870J3QMA4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp870J3QMA4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp870J3QMA4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp870J3QMA4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp870J3QMA4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp870J3QMA4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp870J3QMA4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp870J3QMA4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp870J3QMA4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp870J3QMA4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp870J3QMA4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp870J3QMA4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp870J3QMA4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp870J3QMA4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp870J3QMA4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp870J3QMA4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp870J3QMA4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp870J3QMA4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp870J3QMA4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp870J3QMA4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp870J3QMA4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp870J3QMA4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp870J3QMA4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp870J3QMA4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.7 ms