Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhox13F6YCR7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhox13F6YCR7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rhox13F6YCR7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhox13F6YCR7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhox13F6YCR7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhox13F6YCR7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhox13F6YCR7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhox13F6YCR7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhox13F6YCR7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhox13F6YCR7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhox13F6YCR7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhox13F6YCR7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhox13F6YCR7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhox13F6YCR7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhox13F6YCR7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhox13F6YCR7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhox13F6YCR7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rhox13F6YCR7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhox13F6YCR7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhox13F6YCR7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhox13F6YCR7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhox13F6YCR7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhox13F6YCR7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhox13F6YCR7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhox13F6YCR7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhox13F6YCR7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhox13F6YCR7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox13F6YCR7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox13F6YCR7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox13F6YCR7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhox13F6YCR7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhox13F6YCR7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhox13F6YCR7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhox13F6YCR7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhox13F6YCR7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhox13F6YCR7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhox13F6YCR7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhox13F6YCR7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhox13F6YCR7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhox13F6YCR7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhox13F6YCR7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhox13F6YCR7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhox13F6YCR7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhox13F6YCR7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhox13F6YCR7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhox13F6YCR7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhox13F6YCR7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhox13F6YCR7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhox13F6YCR7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhox13F6YCR7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhox13F6YCR7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhox13F6YCR7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhox13F6YCR7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhox13F6YCR7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhox13F6YCR7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhox13F6YCR7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhox13F6YCR7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rhox13F6YCR7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhox13F6YCR7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhox13F6YCR7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhox13F6YCR7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhox13F6YCR7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhox13F6YCR7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhox13F6YCR7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhox13F6YCR7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhox13F6YCR7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhox13F6YCR7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhox13F6YCR7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhox13F6YCR7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhox13F6YCR7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhox13F6YCR7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhox13F6YCR7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhox13F6YCR7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhox13F6YCR7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhox13F6YCR7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhox13F6YCR7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rhox13F6YCR7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhox13F6YCR7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhox13F6YCR7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhox13F6YCR7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhox13F6YCR7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhox13F6YCR7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhox13F6YCR7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox13F6YCR7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhox13F6YCR7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhox13F6YCR7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhox13F6YCR7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhox13F6YCR7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhox13F6YCR7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhox13F6YCR7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhox13F6YCR7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhox13F6YCR7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhox13F6YCR7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhox13F6YCR7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhox13F6YCR7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhox13F6YCR7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhox13F6YCR7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhox13F6YCR7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhox13F6YCR7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms