Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gcom1E9PZ54 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gcom1E9PZ54 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gcom1E9PZ54 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gcom1E9PZ54 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gcom1E9PZ54 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gcom1E9PZ54 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gcom1E9PZ54 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gcom1E9PZ54 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gcom1E9PZ54 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gcom1E9PZ54 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gcom1E9PZ54 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gcom1E9PZ54 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gcom1E9PZ54 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gcom1E9PZ54 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gcom1E9PZ54 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gcom1E9PZ54 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gcom1E9PZ54 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gcom1E9PZ54 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gcom1E9PZ54 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gcom1E9PZ54 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gcom1E9PZ54 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gcom1E9PZ54 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gcom1E9PZ54 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gcom1E9PZ54 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gcom1E9PZ54 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gcom1E9PZ54 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Gcom1E9PZ54 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gcom1E9PZ54 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gcom1E9PZ54 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Gcom1E9PZ54 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gcom1E9PZ54 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gcom1E9PZ54 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gcom1E9PZ54 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Gcom1E9PZ54 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gcom1E9PZ54 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gcom1E9PZ54 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gcom1E9PZ54 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gcom1E9PZ54 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gcom1E9PZ54 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gcom1E9PZ54 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gcom1E9PZ54 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gcom1E9PZ54 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gcom1E9PZ54 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gcom1E9PZ54 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gcom1E9PZ54 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gcom1E9PZ54 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gcom1E9PZ54 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gcom1E9PZ54 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gcom1E9PZ54 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gcom1E9PZ54 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gcom1E9PZ54 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Gcom1E9PZ54 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gcom1E9PZ54 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gcom1E9PZ54 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Gcom1E9PZ54 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gcom1E9PZ54 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gcom1E9PZ54 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gcom1E9PZ54 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gcom1E9PZ54 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gcom1E9PZ54 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gcom1E9PZ54 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gcom1E9PZ54 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gcom1E9PZ54 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gcom1E9PZ54 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gcom1E9PZ54 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gcom1E9PZ54 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gcom1E9PZ54 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Gcom1E9PZ54 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gcom1E9PZ54 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gcom1E9PZ54 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gcom1E9PZ54 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gcom1E9PZ54 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Gcom1E9PZ54 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gcom1E9PZ54 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gcom1E9PZ54 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gcom1E9PZ54 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gcom1E9PZ54 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gcom1E9PZ54 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gcom1E9PZ54 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gcom1E9PZ54 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gcom1E9PZ54 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gcom1E9PZ54 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gcom1E9PZ54 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gcom1E9PZ54 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gcom1E9PZ54 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gcom1E9PZ54 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gcom1E9PZ54 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gcom1E9PZ54 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gcom1E9PZ54 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gcom1E9PZ54 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gcom1E9PZ54 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gcom1E9PZ54 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gcom1E9PZ54 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gcom1E9PZ54 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gcom1E9PZ54 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gcom1E9PZ54 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gcom1E9PZ54 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Gcom1E9PZ54 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gcom1E9PZ54 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms