Protein–RNA interactions for Protein: A6X935

Itih4, Inter alpha-trypsin inhibitor, heavy chain 4, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itih4A6X935 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itih4A6X935 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itih4A6X935 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itih4A6X935 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itih4A6X935 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itih4A6X935 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itih4A6X935 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itih4A6X935 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itih4A6X935 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itih4A6X935 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itih4A6X935 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itih4A6X935 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itih4A6X935 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itih4A6X935 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itih4A6X935 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itih4A6X935 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itih4A6X935 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itih4A6X935 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itih4A6X935 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itih4A6X935 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itih4A6X935 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itih4A6X935 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itih4A6X935 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itih4A6X935 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itih4A6X935 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itih4A6X935 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itih4A6X935 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itih4A6X935 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itih4A6X935 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itih4A6X935 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itih4A6X935 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itih4A6X935 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itih4A6X935 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itih4A6X935 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itih4A6X935 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itih4A6X935 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itih4A6X935 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itih4A6X935 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itih4A6X935 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itih4A6X935 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itih4A6X935 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itih4A6X935 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itih4A6X935 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Itih4A6X935 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itih4A6X935 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itih4A6X935 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itih4A6X935 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itih4A6X935 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itih4A6X935 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itih4A6X935 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itih4A6X935 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itih4A6X935 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itih4A6X935 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itih4A6X935 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itih4A6X935 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itih4A6X935 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itih4A6X935 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itih4A6X935 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itih4A6X935 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Itih4A6X935 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itih4A6X935 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itih4A6X935 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itih4A6X935 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itih4A6X935 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itih4A6X935 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itih4A6X935 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itih4A6X935 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itih4A6X935 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itih4A6X935 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itih4A6X935 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itih4A6X935 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itih4A6X935 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itih4A6X935 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itih4A6X935 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itih4A6X935 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itih4A6X935 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itih4A6X935 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Itih4A6X935 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Itih4A6X935 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Itih4A6X935 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itih4A6X935 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itih4A6X935 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itih4A6X935 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itih4A6X935 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itih4A6X935 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itih4A6X935 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itih4A6X935 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Itih4A6X935 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itih4A6X935 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itih4A6X935 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itih4A6X935 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itih4A6X935 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itih4A6X935 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itih4A6X935 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itih4A6X935 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itih4A6X935 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itih4A6X935 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itih4A6X935 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itih4A6X935 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itih4A6X935 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms