Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ino80eA0A0U1RP99 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ino80eA0A0U1RP99 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ino80eA0A0U1RP99 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ino80eA0A0U1RP99 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ino80eA0A0U1RP99 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ino80eA0A0U1RP99 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ino80eA0A0U1RP99 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ino80eA0A0U1RP99 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ino80eA0A0U1RP99 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ino80eA0A0U1RP99 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ino80eA0A0U1RP99 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ino80eA0A0U1RP99 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ino80eA0A0U1RP99 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ino80eA0A0U1RP99 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ino80eA0A0U1RP99 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ino80eA0A0U1RP99 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ino80eA0A0U1RP99 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ino80eA0A0U1RP99 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ino80eA0A0U1RP99 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ino80eA0A0U1RP99 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ino80eA0A0U1RP99 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ino80eA0A0U1RP99 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ino80eA0A0U1RP99 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ino80eA0A0U1RP99 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ino80eA0A0U1RP99 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ino80eA0A0U1RP99 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ino80eA0A0U1RP99 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Ino80eA0A0U1RP99 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ino80eA0A0U1RP99 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ino80eA0A0U1RP99 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ino80eA0A0U1RP99 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ino80eA0A0U1RP99 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ino80eA0A0U1RP99 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ino80eA0A0U1RP99 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ino80eA0A0U1RP99 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ino80eA0A0U1RP99 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ino80eA0A0U1RP99 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ino80eA0A0U1RP99 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80eA0A0U1RP99 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80eA0A0U1RP99 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ino80eA0A0U1RP99 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ino80eA0A0U1RP99 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80eA0A0U1RP99 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80eA0A0U1RP99 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80eA0A0U1RP99 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ino80eA0A0U1RP99 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ino80eA0A0U1RP99 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ino80eA0A0U1RP99 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ino80eA0A0U1RP99 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ino80eA0A0U1RP99 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ino80eA0A0U1RP99 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ino80eA0A0U1RP99 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ino80eA0A0U1RP99 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ino80eA0A0U1RP99 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ino80eA0A0U1RP99 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ino80eA0A0U1RP99 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ino80eA0A0U1RP99 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ino80eA0A0U1RP99 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ino80eA0A0U1RP99 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ino80eA0A0U1RP99 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ino80eA0A0U1RP99 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ino80eA0A0U1RP99 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ino80eA0A0U1RP99 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ino80eA0A0U1RP99 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ino80eA0A0U1RP99 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ino80eA0A0U1RP99 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ino80eA0A0U1RP99 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ino80eA0A0U1RP99 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ino80eA0A0U1RP99 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ino80eA0A0U1RP99 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ino80eA0A0U1RP99 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80eA0A0U1RP99 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80eA0A0U1RP99 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms