Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ19

Gm28171, Predicted gene 28171, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28171A0A087WQ19 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm28171A0A087WQ19 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm28171A0A087WQ19 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm28171A0A087WQ19 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm28171A0A087WQ19 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm28171A0A087WQ19 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm28171A0A087WQ19 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm28171A0A087WQ19 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28171A0A087WQ19 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28171A0A087WQ19 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28171A0A087WQ19 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm28171A0A087WQ19 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm28171A0A087WQ19 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm28171A0A087WQ19 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm28171A0A087WQ19 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28171A0A087WQ19 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28171A0A087WQ19 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28171A0A087WQ19 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm28171A0A087WQ19 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm28171A0A087WQ19 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm28171A0A087WQ19 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm28171A0A087WQ19 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm28171A0A087WQ19 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm28171A0A087WQ19 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm28171A0A087WQ19 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28171A0A087WQ19 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28171A0A087WQ19 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28171A0A087WQ19 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm28171A0A087WQ19 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm28171A0A087WQ19 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm28171A0A087WQ19 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm28171A0A087WQ19 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm28171A0A087WQ19 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm28171A0A087WQ19 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm28171A0A087WQ19 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm28171A0A087WQ19 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm28171A0A087WQ19 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm28171A0A087WQ19 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm28171A0A087WQ19 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm28171A0A087WQ19 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm28171A0A087WQ19 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28171A0A087WQ19 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28171A0A087WQ19 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28171A0A087WQ19 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28171A0A087WQ19 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28171A0A087WQ19 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm28171A0A087WQ19 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm28171A0A087WQ19 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm28171A0A087WQ19 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28171A0A087WQ19 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28171A0A087WQ19 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28171A0A087WQ19 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28171A0A087WQ19 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm28171A0A087WQ19 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm28171A0A087WQ19 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm28171A0A087WQ19 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm28171A0A087WQ19 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm28171A0A087WQ19 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm28171A0A087WQ19 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm28171A0A087WQ19 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28171A0A087WQ19 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28171A0A087WQ19 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28171A0A087WQ19 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28171A0A087WQ19 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28171A0A087WQ19 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28171A0A087WQ19 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28171A0A087WQ19 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28171A0A087WQ19 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28171A0A087WQ19 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28171A0A087WQ19 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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