Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm14339-201ENSMUST00000146224 423 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm43815-201ENSMUST00000197676 990 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 9530078K11Rik-201ENSMUST00000208883 694 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm45475-201ENSMUST00000209381 309 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 AC160635.1-201ENSMUST00000216731 474 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Olfr419-201ENSMUST00000061990 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm4956-201ENSMUST00000082032 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm26561-201ENSMUST00000180743 1413 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 A230001M10Rik-203ENSMUST00000198712 1747 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Fam49a-205ENSMUST00000223061 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Apela-202ENSMUST00000142822 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm8010-201ENSMUST00000194128 873 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm39456-201ENSMUST00000214759 1019 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 AV026068-225ENSMUST00000225042 490 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm7086-202ENSMUST00000228849 506 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms