Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm26929-201ENSMUST00000182703 753 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm3142-201ENSMUST00000190107 414 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm38033-201ENSMUST00000192037 269 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Prkar2a-206ENSMUST00000195405 1143 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Gm45155-201ENSMUST00000207365 596 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Tmem147-206ENSMUST00000208169 537 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm5609-201ENSMUST00000210008 1267 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 5033426E14Rik-201ENSMUST00000212462 783 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 AC159649.1-201ENSMUST00000220851 977 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 AC165254.1-203ENSMUST00000222925 574 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Gm26244-201ENSMUST00000083435 164 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Btg1-ps2-201ENSMUST00000089060 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Ttc29-201ENSMUST00000049395 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm16233-201ENSMUST00000136170 1623 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Serpina3k-201ENSMUST00000043058 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm38947-201ENSMUST00000209940 2720 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 4930466I24Rik-201ENSMUST00000144105 2264 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Mapk9-202ENSMUST00000043321 1297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 CT025600.1-202ENSMUST00000220264 2510 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 AC153862.1-201ENSMUST00000215700 3349 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Grip1-204ENSMUST00000105261 3608 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Grip1-215ENSMUST00000148954 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
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