Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Pkp4-203ENSMUST00000112577 4222 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Zfp541-201ENSMUST00000108509 4561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 AC159379.2-201ENSMUST00000220244 2482 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Ocln-202ENSMUST00000069756 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 A830010M20Rik-201ENSMUST00000060553 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Adgrl3-218ENSMUST00000122037 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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PtprtQ99M80 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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PtprtQ99M80 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Lmod1-201ENSMUST00000059352 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Rbm28-201ENSMUST00000007993 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Patj-202ENSMUST00000041284 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Adgrf4-203ENSMUST00000167993 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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PtprtQ99M80 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Scml4-202ENSMUST00000105494 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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PtprtQ99M80 1700006J14Rik-203ENSMUST00000160091 2629 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Zfp800-201ENSMUST00000035930 3881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Sox6-212ENSMUST00000206369 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Ccdc77-201ENSMUST00000032283 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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