Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3A2

Cdpf1, Cysteine-rich DPF motif domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdpf1Q8R3A2 D830032E09Rik-203ENSMUST00000189845 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Prb1-201ENSMUST00000087853 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Ggt5-201ENSMUST00000072217 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm10364-201ENSMUST00000076633 1328 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Zfp940-201ENSMUST00000085792 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Mkrn2-201ENSMUST00000000449 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Rabl3-201ENSMUST00000023524 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Nr6a1-201ENSMUST00000076275 5941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm1982-201ENSMUST00000188615 1887 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Mad2l1-201ENSMUST00000101343 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Wdr12-203ENSMUST00000122038 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Ceacam20-201ENSMUST00000094753 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Olfr981-202ENSMUST00000215956 8197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Ambn-202ENSMUST00000198265 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Tex52-202ENSMUST00000130785 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Nlrp14-202ENSMUST00000142623 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 CT572991.1-201ENSMUST00000222755 1423 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Arsg-201ENSMUST00000020928 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Igkv4-58-201ENSMUST00000103355 292 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm14561-201ENSMUST00000117376 798 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm13682-201ENSMUST00000117524 702 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm14141-201ENSMUST00000120236 783 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm8778-201ENSMUST00000127246 1107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm18828-201ENSMUST00000180475 857 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Mir7060-201ENSMUST00000183486 137 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm29371-201ENSMUST00000186823 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Prkar2a-206ENSMUST00000195405 1143 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm17835-201ENSMUST00000196870 499 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Ugt2a3-201ENSMUST00000031195 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Cdpf1Q8R3A2 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Nbr1-207ENSMUST00000107218 3353 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Slc5a4b-201ENSMUST00000120757 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Map4k4-209ENSMUST00000192509 3918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Pex5l-210ENSMUST00000193681 3620 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Ints10-202ENSMUST00000070713 4192 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Zranb1-201ENSMUST00000033265 2210 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Dhx30-204ENSMUST00000196171 3885 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm37818-201ENSMUST00000194952 3169 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm9105-201ENSMUST00000120160 1398 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm44639-201ENSMUST00000205859 3009 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Sulf2-207ENSMUST00000146497 3808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Rnf6-208ENSMUST00000169407 3276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gpbp1-201ENSMUST00000047627 3694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Ttc16-201ENSMUST00000066478 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Mlst8-202ENSMUST00000179163 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Grk1-202ENSMUST00000209909 7431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Grk1-201ENSMUST00000033827 7425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Mlst8-201ENSMUST00000070888 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cdpf1Q8R3A2 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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