Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm5915-201ENSMUST00000116136 454 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm11997-201ENSMUST00000118697 313 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm12206-201ENSMUST00000119795 601 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm13543-201ENSMUST00000121230 796 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Olfr330-201ENSMUST00000134055 1134 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm13012-202ENSMUST00000155349 849 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm3147-201ENSMUST00000180178 1221 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm10424-201ENSMUST00000180232 1221 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm42997-201ENSMUST00000196074 918 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm18118-201ENSMUST00000201064 645 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm44778-201ENSMUST00000206447 668 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Zranb1-201ENSMUST00000033265 2210 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Defa28-201ENSMUST00000098887 400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Rps8-ps2-201ENSMUST00000118709 624 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm6292-201ENSMUST00000120712 1095 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm14438-201ENSMUST00000121572 624 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm29436-202ENSMUST00000189054 1172 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm34358-201ENSMUST00000204585 665 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm7476-201ENSMUST00000220112 661 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Rpl31-201ENSMUST00000086535 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Ddias-201ENSMUST00000032877 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 C87977-202ENSMUST00000105754 1407 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms