Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 A530041M06Rik-201ENSMUST00000199690 2288 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
XpcP51612 Ptprb-203ENSMUST00000218553 7016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
XpcP51612 Eif4b-201ENSMUST00000169681 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
XpcP51612 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
XpcP51612 Crtam-201ENSMUST00000034519 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
XpcP51612 Hist2h2be-201ENSMUST00000090781 2620 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
XpcP51612 Uroc1-202ENSMUST00000164761 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gas8-203ENSMUST00000212923 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
XpcP51612 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
XpcP51612 Oog4-201ENSMUST00000061277 1981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
XpcP51612 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
XpcP51612 Ufm1-203ENSMUST00000146598 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
XpcP51612 Lrrc28-201ENSMUST00000032775 1817 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
XpcP51612 1700024J04Rik-201ENSMUST00000093146 1821 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm33994-201ENSMUST00000193724 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm38110-201ENSMUST00000194594 1551 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 A530064D06Rik-202ENSMUST00000053612 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Dusp3-203ENSMUST00000107173 4311 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Fn3k-203ENSMUST00000103014 3841 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Tnfaip1-202ENSMUST00000108277 3768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Fignl1-206ENSMUST00000171080 2844 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Cblb-206ENSMUST00000227879 3866 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 L1td1-202ENSMUST00000154279 2942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Vmn2r41-201ENSMUST00000168807 3617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 St6gal1-206ENSMUST00000178797 4177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm17572-201ENSMUST00000171455 420 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 4933403L11Rik-201ENSMUST00000193857 1121 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm34611-201ENSMUST00000223252 627 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 AC167019.4-201ENSMUST00000226494 1070 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Olfr980-201ENSMUST00000073932 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Cwc25-201ENSMUST00000018685 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Enox2-205ENSMUST00000114918 3226 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Slc5a6-205ENSMUST00000202520 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Slc5a6-201ENSMUST00000080431 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Vsig1-201ENSMUST00000033806 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Myom1-203ENSMUST00000179759 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 4930470B04Rik-201ENSMUST00000192005 1926 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Triml2-204ENSMUST00000210136 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Gm45237-202ENSMUST00000211157 2452 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 AC163040.1-201ENSMUST00000222979 4288 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 AC093043.2-201ENSMUST00000228616 2017 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Olfr628-201ENSMUST00000098193 1553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Zscan26-201ENSMUST00000032820 3918 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Uhrf1-203ENSMUST00000113038 3483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 AI182371-206ENSMUST00000226631 1680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Tbx19-201ENSMUST00000027859 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
XpcP51612 Clasp1-214ENSMUST00000189570 5502 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
XpcP51612 Ikbke-201ENSMUST00000062108 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
XpcP51612 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
XpcP51612 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
XpcP51612 Ceacam19-201ENSMUST00000052605 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
XpcP51612 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms