Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms