Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
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Ccl20O89093 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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Ccl20O89093 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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Ccl20O89093 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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Ccl20O89093 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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Ccl20O89093 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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Ccl20O89093 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
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Ccl20O89093 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
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Ccl20O89093 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms