Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm11203-201ENSMUST00000122169 741 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm16429-201ENSMUST00000179824 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm20587-201ENSMUST00000186367 1186 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Avpr1b-202ENSMUST00000190410 623 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 RMST_1.1-214ENSMUST00000220389 633 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Mas1-206ENSMUST00000162333 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm28077-201ENSMUST00000190250 1635 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC5.77□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Mrps18c-202ENSMUST00000112898 460 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Cldn20-201ENSMUST00000168560 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.4 ms