Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm6685D3YYP3 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms