Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Adgrl3-218ENSMUST00000122037 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Col5a3Q9JLI2 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Nsd2-201ENSMUST00000058096 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Hivep2-201ENSMUST00000015645 9763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gbp7-202ENSMUST00000171263 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 AC160637.1-201ENSMUST00000214037 3887 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 H6pd-202ENSMUST00000084117 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Col5a3Q9JLI2 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm44902-201ENSMUST00000206177 805 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Col5a3Q9JLI2 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Col5a3Q9JLI2 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Col5a3Q9JLI2 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Col5a3Q9JLI2 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Col5a3Q9JLI2 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Sgsh-202ENSMUST00000100172 4223 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Scn3b-201ENSMUST00000049941 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Grb10-203ENSMUST00000109654 4755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms