Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Veph1-201ENSMUST00000029419 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Ccdc180-204ENSMUST00000178561 5081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Fam168a-201ENSMUST00000049053 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Pogz-205ENSMUST00000107270 6399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Tbx22-203ENSMUST00000168174 5217 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Sptan1-202ENSMUST00000095083 7883 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Tecta-201ENSMUST00000042190 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Map3k7-204ENSMUST00000108184 5491 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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