Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 B430306N03Rik-201ENSMUST00000049614 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Map2-207ENSMUST00000114018 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Qrich2-204ENSMUST00000208602 7260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Prokr1-203ENSMUST00000204682 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccdc18Q640L5 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Acsl6-204ENSMUST00000093106 5804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Prdm16-204ENSMUST00000105636 8426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Dclk1-207ENSMUST00000198412 4282 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Smpd4-203ENSMUST00000090159 4565 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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