Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Plch1-208ENSMUST00000160638 6271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm43686-201ENSMUST00000197351 2439 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm12455-201ENSMUST00000121242 416 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
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Usp48Q3V0C5 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
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Usp48Q3V0C5 Dclre1b-204ENSMUST00000106834 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Vipas39-201ENSMUST00000021426 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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Usp48Q3V0C5 Ift81-201ENSMUST00000031426 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Usp48Q3V0C5 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Eapp-206ENSMUST00000163433 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Usp48Q3V0C5 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Usp48Q3V0C5 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
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Usp48Q3V0C5 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Lockd-201ENSMUST00000183867 5662 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Dip2b-201ENSMUST00000023768 4323 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Kctd16-201ENSMUST00000091927 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 CT009530.1-201ENSMUST00000227348 2927 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm38251-201ENSMUST00000192968 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Paics-202ENSMUST00000117536 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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