Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Fmr1-202ENSMUST00000114653 4058 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Arhgef9-205ENSMUST00000113883 5399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Olfr1414-201ENSMUST00000062353 6017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 F5-201ENSMUST00000086040 7430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Myo6-203ENSMUST00000113266 7632 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 A530041M06Rik-201ENSMUST00000199690 2288 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Sorbs2-215ENSMUST00000135336 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Zfp507-201ENSMUST00000061586 6693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Map3k7-203ENSMUST00000108183 5416 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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