Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm5514-201ENSMUST00000060477 306 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms