Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm42538-201ENSMUST00000196233 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Spaca7-203ENSMUST00000210276 715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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VhlP40338 1700015G11Rik-201ENSMUST00000180038 397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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VhlP40338 4930535O05Rik-201ENSMUST00000184406 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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VhlP40338 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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VhlP40338 4930471E19Rik-202ENSMUST00000219150 737 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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VhlP40338 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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VhlP40338 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VhlP40338 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VhlP40338 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VhlP40338 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
VhlP40338 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
VhlP40338 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VhlP40338 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
VhlP40338 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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