Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Arpp21-203ENSMUST00000111872 3316 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Arpp21-229ENSMUST00000164754 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Chid1-203ENSMUST00000118694 3910 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 B430306N03Rik-201ENSMUST00000049614 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Stk11ip-202ENSMUST00000113553 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Pik3cg-207ENSMUST00000220366 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Olfr1219-202ENSMUST00000213724 5669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Mmrn2-201ENSMUST00000111908 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Tex9-201ENSMUST00000085358 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Dlk1-206ENSMUST00000109846 4106 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Dusp27-202ENSMUST00000192369 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Unc45b-202ENSMUST00000108160 4152 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms