Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm31152-201ENSMUST00000210319 2171 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Map3k19-205ENSMUST00000208183 4865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Olfr319-203ENSMUST00000215962 2500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Map1a-201ENSMUST00000094639 11825 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 A830036E02Rik-204ENSMUST00000139095 3413 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Tbc1d15-201ENSMUST00000020339 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm14144-201ENSMUST00000128602 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Mkrn2-201ENSMUST00000000449 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Rab2b-202ENSMUST00000100631 2619 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm43080-201ENSMUST00000199006 2643 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Dlgap5-201ENSMUST00000043296 2964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Inpp5d-210ENSMUST00000169754 4937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Kcnma1-206ENSMUST00000163322 3162 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gbp8-201ENSMUST00000031235 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Cacnb2-214ENSMUST00000193800 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm26569-201ENSMUST00000181968 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm45821-201ENSMUST00000211967 1757 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Abcb11-204ENSMUST00000180142 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm16429-201ENSMUST00000179824 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm8802-201ENSMUST00000118633 740 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm12178-201ENSMUST00000120545 330 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Rpl21-ps8-201ENSMUST00000130005 478 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Ighv1-62-2-201ENSMUST00000163467 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm43518-201ENSMUST00000166129 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Ighv1-71-201ENSMUST00000166645 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm37841-201ENSMUST00000195367 376 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm5981-201ENSMUST00000199912 487 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm7546-202ENSMUST00000211354 275 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 4930471E19Rik-202ENSMUST00000219150 737 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC171241.2-201ENSMUST00000228744 892 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Guca2a-201ENSMUST00000024015 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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Hoxd9P28357 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Tecta-201ENSMUST00000042190 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Paqr8-204ENSMUST00000189400 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gpnmb-201ENSMUST00000031840 3701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Slc18b1-201ENSMUST00000119597 2837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Esrrg-201ENSMUST00000027906 5293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Rai14-201ENSMUST00000090339 4909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gcnt2-201ENSMUST00000067778 4038 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Olfr1384-202ENSMUST00000213776 4437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Pogk-203ENSMUST00000131487 8692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Mroh4-202ENSMUST00000137963 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Zfp819-201ENSMUST00000032661 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Olfr923-203ENSMUST00000213619 2846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Serpina3i-201ENSMUST00000109958 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Rbx1-201ENSMUST00000023036 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Ablim3-202ENSMUST00000166783 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Ap3b1-201ENSMUST00000022196 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps103-201ENSMUST00000120171 893 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm15009-201ENSMUST00000121387 322 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
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