Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RhoP15409 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RhoP15409 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RhoP15409 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RhoP15409 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RhoP15409 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RhoP15409 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RhoP15409 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RhoP15409 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RhoP15409 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RhoP15409 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RhoP15409 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RhoP15409 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RhoP15409 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RhoP15409 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RhoP15409 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RhoP15409 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RhoP15409 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Nt5c2-201ENSMUST00000086961 3745 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RhoP15409 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
RhoP15409 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RhoP15409 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RhoP15409 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RhoP15409 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
RhoP15409 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RhoP15409 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
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