Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm11203-201ENSMUST00000122169 741 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 BC065403-202ENSMUST00000184796 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Mir6919-201ENSMUST00000185146 62 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm30692-201ENSMUST00000208709 801 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Mup1-202ENSMUST00000103012 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Mup16-202ENSMUST00000107483 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Zfp113-202ENSMUST00000132318 488 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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Ccl20O89093 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Rbx1-ps-201ENSMUST00000173786 327 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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Ccl20O89093 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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Ccl20O89093 Mup19-201ENSMUST00000080606 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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