Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Vmn2r-ps99-202ENSMUST00000223517 2338 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Specc1-207ENSMUST00000201364 4955 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usf3B2RUQ2 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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