Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Rad51ap1-201ENSMUST00000112220 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Dennd2d-204ENSMUST00000183271 2050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Hdhd2-208ENSMUST00000148955 3069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm36952-201ENSMUST00000194923 3625 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Eif2ak4-202ENSMUST00000102527 4906 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1347-202ENSMUST00000207339 1737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Exoc1-203ENSMUST00000113493 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm42899-201ENSMUST00000197034 2667 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Calr4-203ENSMUST00000106629 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 9330121K16Rik-201ENSMUST00000211464 3886 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Map3k7-204ENSMUST00000108184 5491 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Zkscan1-201ENSMUST00000019660 8261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Lypd8-201ENSMUST00000013787 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm8065-201ENSMUST00000164048 605 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm38242-201ENSMUST00000192354 430 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm7115-201ENSMUST00000193706 832 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm38289-201ENSMUST00000194273 597 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm7478-201ENSMUST00000201054 581 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 2310008N11Rik-202ENSMUST00000210263 422 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r7-201ENSMUST00000027494 10315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Pygb-201ENSMUST00000045441 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Trim40-203ENSMUST00000172711 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Ift81-201ENSMUST00000031426 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm28250-201ENSMUST00000187025 2168 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm37157-201ENSMUST00000192120 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm37112-201ENSMUST00000194389 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Zfp74-201ENSMUST00000032797 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Me1-202ENSMUST00000185374 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Clcn3-205ENSMUST00000110302 3768 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm37315-201ENSMUST00000194347 3479 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Mss51-201ENSMUST00000022353 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 D3Ertd751e-208ENSMUST00000192193 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm42866-201ENSMUST00000195919 3304 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Sema5a-201ENSMUST00000067458 10809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Tmem209-203ENSMUST00000115157 2273 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Sun1-206ENSMUST00000110884 3955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 1700074P13Rik-202ENSMUST00000122181 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d14-215ENSMUST00000146430 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d14-201ENSMUST00000031094 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Smim23-202ENSMUST00000109365 331 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm12055-201ENSMUST00000143643 793 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Mir6999-201ENSMUST00000183498 61 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm29545-201ENSMUST00000188878 694 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm36996-201ENSMUST00000194466 250 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm40040-201ENSMUST00000196123 504 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm45515-201ENSMUST00000210796 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 AC153968.1-201ENSMUST00000215584 334 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Slurp2-201ENSMUST00000057932 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 D5Ertd615e-202ENSMUST00000197016 3911 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms