Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm42431-201ENSMUST00000196880 323 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 1700081B01Rik-202ENSMUST00000197543 648 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm20110-201ENSMUST00000218263 2095 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 3110009F21Rik-201ENSMUST00000223217 1625 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm34611-201ENSMUST00000223252 627 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AC126691.2-201ENSMUST00000226185 249 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AC124709.1-201ENSMUST00000227296 620 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AC156790.4-202ENSMUST00000228838 1418 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Slurp1-201ENSMUST00000023261 567 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Adam18-201ENSMUST00000033957 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Hist1h1t-201ENSMUST00000041052 912 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm21957-201ENSMUST00000073056 438 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gpr55-201ENSMUST00000086975 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm16026-201ENSMUST00000094774 580 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Wdr27-206ENSMUST00000228330 2759 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm36879-201ENSMUST00000212313 2060 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Sp100-210ENSMUST00000147552 1597 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Cyp4a29-201ENSMUST00000118278 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm28670-201ENSMUST00000185365 1498 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm29537-202ENSMUST00000186153 1498 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm29497-201ENSMUST00000186801 1498 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm28568-201ENSMUST00000187762 1498 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm29445-202ENSMUST00000189947 1497 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm28458-202ENSMUST00000190542 1497 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm28457-202ENSMUST00000191277 1498 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm37654-201ENSMUST00000193019 1498 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm7203-201ENSMUST00000210880 1404 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm8605-201ENSMUST00000221619 1370 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Erp44-201ENSMUST00000030028 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm22760-201ENSMUST00000102277 93 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm12883-201ENSMUST00000117867 364 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm8802-201ENSMUST00000118633 740 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm12170-201ENSMUST00000119281 300 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm14131-201ENSMUST00000119636 719 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm12780-201ENSMUST00000122458 645 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm12594-201ENSMUST00000132140 499 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm12089-201ENSMUST00000138402 428 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Trp53-ps-201ENSMUST00000166597 141 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm17258-201ENSMUST00000168462 1266 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm6871-204ENSMUST00000171059 462 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm23413-201ENSMUST00000175521 125 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm5350-201ENSMUST00000182057 1002 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm27651-201ENSMUST00000183465 246 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm29068-201ENSMUST00000191607 400 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm37247-201ENSMUST00000192549 730 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm18988-201ENSMUST00000205601 746 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm7850-201ENSMUST00000212909 712 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 C230072F16Rik-201ENSMUST00000219184 1253 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 A930040O22Rik-201ENSMUST00000221662 973 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
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