Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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Trim39Q9ESN2 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Trim39Q9ESN2 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Hnrnpk-205ENSMUST00000176207 2653 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Olfr554-203ENSMUST00000215995 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Trim39Q9ESN2 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 4921515L22Rik-201ENSMUST00000218993 1537 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Trim39Q9ESN2 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Trim39Q9ESN2 Gm26520-201ENSMUST00000180719 1423 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Trim39Q9ESN2 Itgb1bp2-201ENSMUST00000033674 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Trim39Q9ESN2 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Trim39Q9ESN2 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Trim39Q9ESN2 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Trim39Q9ESN2 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Trim39Q9ESN2 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 AC107711.5-201ENSMUST00000228149 594 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Calcr-201ENSMUST00000075644 3763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Gsdma2-202ENSMUST00000093938 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Gm37065-203ENSMUST00000192498 1622 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 4930425K24Rik-201ENSMUST00000222054 2143 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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