Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Kirrel3-206ENSMUST00000187625 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Phf8-201ENSMUST00000046950 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm45746-201ENSMUST00000212623 2447 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 AC138284.3-201ENSMUST00000217345 4663 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Fndc1-202ENSMUST00000097425 5845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Ano7-202ENSMUST00000186641 3984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Sycp1-201ENSMUST00000029448 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm43336-201ENSMUST00000200487 4504 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Ptprb-203ENSMUST00000218553 7016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Arhgap17-211ENSMUST00000207010 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Sema6a-203ENSMUST00000115449 6815 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Tcaim-201ENSMUST00000052740 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm37739-201ENSMUST00000191742 1505 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Diaph1-203ENSMUST00000115629 5416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Pde7b-201ENSMUST00000020165 4137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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