Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 F5-201ENSMUST00000086040 7430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm884-202ENSMUST00000167262 4576 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Akap2-204ENSMUST00000102902 6993 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm38661-201ENSMUST00000216555 5814 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Sema6a-201ENSMUST00000019791 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Akap2-207ENSMUST00000107600 7231 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms